Впервые Саламандры открыто приняли участие в Бадабской войне в 906.М41, хотя многие годы они с растущей тревогой следили за событиями Бадабской схизмы. Ноктюрн находится на значительном удалении от Зоны Мальстрима, но Саламандры не раз здесь бывали и принимали участие в местных конфликтах, благодаря стабильному варп-пути через регион Тусклых Звезд. Нежелание ордена вмешиваться в войну усиливалось тем, что Саламандры относительно недавно сражались вместе с Астральными Когтями и Огненными Ястребами в кампании в Ликантском Течении в 810-х М41. Орден очень беспокоился из-за зарождающегося конфликта и отказывался принимать чью-либо сторону, несмотря на прямые призывы как Астральных Когтей, так и Огненных Ястребов на ранних этапах конфликта. Это продолжалось до тех пор, пока инквизитор Фрайн не представил доказательства того, что орден Гурона отринул все свои древние соглашения, поэтому Саламандрам в конечном итоге пришлось вступить в войну. К сожалению, большая часть ордена была занята в других конфликтах, поэтому Саламандры быстро собрали все доступные войска, которые возглавил капитан потрепанной боями второй роты Пеллас Мир’сан. Этот воин в будущем сыграет важную роль в войне и ее последствиях. По большей части группировка состояла из Саламандр второй роты, которые восстанавливали силы и перевооружались после тяжелой войны с Железными Воинами в туманности Головы Смерти. К роте присоединились резервные части из гарнизона Ноктюрна, а также несколько ветеранов-инструкторов и около тридцати Огненных Драконов, которые служили телохранителями Мир’сана. Они были обеспечены кораблями, транспортом и оружием из хранилищ на Прометее. Саламандры так разгневались на Тирана, что группировку усилил Гекстад Древних: шести почтенным дредноутам ордена, некоторые из которых не просыпались уже более четырех столетий, предстояло делиться вековечной мудростью с Мир’саном и изливать свой гнев на врагов ордена. Группировка Саламандр, хотя и была относительно небольшой по сравнению с некоторыми контингентами лоялистов, до самого конца войны принимала активное участие в космических и наземных сражениях. Орден сыграл ключевую роль в некоторых важнейших событий Бадабской войны, например, в Ангстромском инциденте, вторжении на Шаприас и отделении ордена Палачей от остальных сепаратистов, последовавшем за событиями «Красного Часа» и финальной осады Бадаба.